科技服务手册

EP-01

ATAC-seq、ChIP-seq分析服务

解析染色质开放区域、转录因子结合位点及组蛋白修饰特征，构建调控网络。

适合：研究转录调控、表观遗传机制、转录因子或组蛋白修饰的课题组。

主要交付质控报告、Peak注释、差异区域、Motif富集、可视化图表

TR-01

Microarray基因芯片数据基础分析

面向常见表达芯片平台开展数据预处理、标准化、差异分析和功能注释。

适合：拥有GEO、自有芯片或历史表达数据，需要完成基础结果整理的研究人员。

主要交付质控、标准化矩阵、差异基因、富集分析、标准图表

TR-02

RNA-seq数据分析

从原始测序数据质控、比对和定量，到差异表达、通路富集及结果解释。

适合：开展疾病机制、药物干预、基因功能或不同处理条件比较的科研团队。

主要交付表达矩阵、差异结果、GO/KEGG富集、可视化与分析报告

EP-02

单细胞甲基化分析

在单细胞分辨率下刻画DNA甲基化异质性，识别细胞类型相关表观调控特征。

适合：关注肿瘤异质性、发育过程、细胞命运和表观调控变化的前沿研究团队。

主要交付细胞质控、甲基化水平、聚类注释、差异甲基化区域

TR-03

单细胞转录组分析

解析细胞异质性、细胞亚群、状态变化、发育轨迹和细胞间通讯。

适合：需要解析复杂组织细胞组成、疾病微环境或细胞发育轨迹的研究人员。

主要交付细胞注释、标志基因、拟时序、通讯分析、差异与富集结果

CD-01

分子动力学模拟

评估蛋白或蛋白-配体复合物的稳定性、构象变化和关键相互作用。

适合：开展药物靶点、蛋白结构、分子对接验证和先导化合物研究的团队。

主要交付RMSD/RMSF、氢键、回转半径、自由能地形与轨迹解读

ML-01

多种机器学习预后模型

整合临床与组学特征，开展特征筛选、生存建模、风险分层与内外部验证。

适合：拥有随访结局、临床队列或公共组学数据，研究生存风险与预后的团队。

主要交付模型比较、风险评分、KM曲线、ROC/C-index、校准与决策曲线

ML-02

多种机器学习诊断模型

使用多算法筛选诊断标志物，比较模型性能并评估泛化能力与临床价值。

适合：开展疾病分类、早期筛查、生物标志物发现或辅助诊断研究的团队。

主要交付特征筛选、模型比较、混淆矩阵、ROC、校准与解释图

ST-01

孟德尔随机化与因果推断

利用遗传变异工具变量评估暴露与结局间的潜在因果关系，并开展稳健性检验。

适合：使用GWAS汇总数据验证危险因素、药物靶点或生物标志物因果效应的研究人员。

主要交付工具变量筛选、MR结果、异质性、多效性、敏感性分析

MB-01

微生物扩增子测序分析

支持16S、18S和ITS扩增子数据分析，评估群落组成、多样性和组间差异。

适合：研究肠道菌群、环境微生物、农业生态或处理前后群落变化的团队。

主要交付物种注释、Alpha/Beta多样性、差异菌群、功能预测

TR-04

小RNA测序分析

识别和定量miRNA等小RNA，开展差异分析、靶基因预测及调控网络构建。

适合：研究miRNA调控、非编码RNA、外泌体或疾病分子标志物的科研人员。

主要交付小RNA鉴定、表达定量、差异分析、靶基因与功能富集

CD-02

小分子药物虚拟筛选

基于靶点结构和化合物库开展高通量虚拟筛选、分子对接及候选分子排序。

适合：已有明确靶点或候选化合物库，希望缩小实验筛选范围的药物研发团队。

主要交付筛选流程、对接评分、关键作用位点、候选清单与ADMET建议

TR-05

转录组测序与标准分析

提供样本质检、文库构建、测序及标准生信分析的一体化技术服务。

适合：具备组织、细胞或RNA样本，需要从实验测序开始获得完整结果的客户。

主要交付测序数据、质控结果、表达定量、差异与功能分析报告